动物医学进展,2023,44(2):78-83ProgressinVeterinaryMedicine不同日龄仔猪肠道菌群的组成与差异收稿日期:2021-09-23基金项目:湖南省教育厅科学研究项目(18A109)作者简介:刘丹(1997-),女,内蒙古阿荣旗人,硕士研究生,主要从事哺乳动物肠道抗菌肽研究。*通讯作者刘丹1,2,孟江海1,曹斌1,李灿1,曾维1,纪春晓1,陈韬1,2*(1.湖南农业大学动物医学院,湖南长沙410128;2.湖南省兽药工程技术研究中心,湖南长沙410128)摘要:为确定新生仔猪肠道菌群组成以及新生仔猪不同发育阶段肠道菌群的分布和变化,并探讨仔猪肠道不同发育阶段各个优势菌群的功能,找到仔猪肠道菌群的演变规律。试验选取不同日龄(0、5、10、15、20、25、30d)健康二元仔猪,收集其结肠内容物,用16SrRNA基因高通量测序方法,分析不同日龄仔猪肠道菌群的菌群分布和变化。通过Alpha多样性分析显示,不同日龄仔猪肠道菌群存在多样性差异,其0d~20d的多样性呈现下降趋势,而20d~30d的多样性呈现上升趋势;在门水平,肠道菌群主要由Firmicutes(43.5%)、Bacteroidota(26.9%)两个门组成,占比为70.4%。不同日龄仔猪的Firmicutes和Bacteroidota变化趋势各不相同;在属水平,不同生长阶段的优势菌属各不同,断奶前仔猪Lactobacillus、Bacteroidota等与碳水化合物等营养物质代谢相关的菌属丰度较高;断奶后Prevotella、RuminococceaceaeUCG-005、Allo-prevotella等与纤维消化有关的菌属丰度较高。肠道菌群的组成在生长的不同阶段是动态变化的。Beta多样性分析显示,同一日龄不同个体的物种多样性存在差异,尤其刚出生时(0d)和断奶后(25d)不同个体的物种多样性之间具有显著差异。说明仔猪肠道菌群的微生物组成在生长的不同阶段是动态变化的,且不同个体的物种多样性均有较大差异。关键词:仔猪;肠道菌群;16SrRNA基因测序;差异分析中图分类号:S856.4文献标识码:A文章编号:1007-5038(2023)02-0078-06新一代测序技术极大地拓展了人们对肠道微生物群在人类健康和疾病中作用的认识。猪是人类重要的蛋白质来源和人类疾病的生物医学模型,使猪肠道微生物群越来越受到关注。特别是在猪的关键生长阶段,肠道微生物在猪的健康和生产中发挥着重要的作用[1]。由于各种应激、肠道屏障功能降低和病原体感染增加,断奶与肠道微生物群失调有关[2]。通过益生菌和益生元调节猪肠道微生物以维持健康微生物群可有效预防病原体感染和促进有益细菌丰度[3]。有研究收集273份直肠拭子和粪便分别进行测序和粪便微生物群移植,共检测到19个菌门,其中厚壁菌门(...
