收稿日期:２０２２－０７－１３修回日期:２０２２－１１－０４基金项目:福建省林业科技项目(２０２１ＦＫＪ２４)ꎻ福建省科技创新领军人才专项(１１８/ＫＲＣ１６００６Ａ)ꎮ作者简介:丁祥青(１９９７—)ꎬ男ꎮ研究方向:园林植物与应用ꎮＥｍａｉｌ:３０３５９６８１４＠ｑｑ.ｃｏｍꎮ通信作者邹双全(１９６３—)ꎬ男ꎬ研究员ꎮ研究方向:森林培育与药用观赏植物栽培ꎮＥｍａｉｌ:ｚｏｕ＠ｆａｆｕ.ｅｄｕ.ｃｎꎮ１１种金花茶叶绿体基因组密码子偏好性分析丁祥青１ꎬ２ꎬ陈丝雨２ꎬ陈佳婷１ꎬ毕远洋１ꎬ曾姣艳３ꎬ邹双全２(１.福建农林大学园林学院ꎬ福建福州３５０００２ꎻ２.福建农林大学林学院ꎬ福建福州３５０００２ꎻ３.福州外语外贸学院ꎬ福建福州３５０２０２)摘要:对１１种金花茶植物叶绿体全基因组序列进行蛋白编码序列筛选ꎬ利用ＥＭＢＯＳＳ在线程序、ＣｏｄｏｎＷ、Ｅｘｃｅｌ、ＭＥＧＡ７、ＳＰＳＳ、ＴＢｔｏｏｌｓ等软件解析了１１种金花茶叶绿体基因组密码子使用模式ꎬ探讨了其密码子偏好性的主要影响因素ꎮ结果表明:１１种金花茶叶绿体基因组密码子使用偏好性均较弱ꎬ蛋白质编码区序列富含Ａ/Ｕ碱基ꎬ密码子第３位以Ａ/Ｕ结尾为主ꎮ金花茶叶绿体基因组密码子偏好性形成受选择压力、突变压力等多种因素共同影响ꎬ主要受选择压力影响ꎮ确定了１１种金花茶叶绿体基因组的１０个相同的最优密码子ꎬ分别为ＧＣＡ、ＧＣＵ、ＵＧＵ、ＧＡＡ、ＡＡＡ、ＣＵＵ、ＵＵＡ、ＣＡＡ、ＣＧＵ和ＧＵＵꎮ此外ꎬ金花茶叶绿体基因组相对同义密码子使用度的聚类结果为金花茶的系统进化研究提供了依据ꎮ开放科学(资源服务)标识码(ＯＳＩＤ)关键词:金花茶ꎻ叶绿体基因组ꎻ密码子偏好性ꎻ系统进化中图分类号:Ｓ７１８.４６文献标识码:Ａ文章编号:１６７１￣５４７０(２０２３)０４￣０４７３￣０７ＤＯＩ:１０.１３３２３/ｊ.ｃｎｋｉ.ｊ.ｆａｆｕ(ｎａｔ.ｓｃｉ.).２０２３.０４.００７Ｃｏｄｏｎｂｉａｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆ１１ｙｅｌｌｏｗＣａｍｅｌｌｉａｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔｇｅｎｏｍｅＤＩＮＧＸｉａｎｇｑｉｎｇ１ꎬ２ꎬＣＨＥＮＳｉｙｕ２ꎬＣＨＥＮＪｉａｔｉｎｇ１ꎬＢＩＹｕａｎｙａｎｇ１ꎬＺＥＮＧＪｉａｏｙａｎ３ꎬＺＯＵＳｈｕａｎｇｑｕａｎ２(１.ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＬａｎｄｓｃａｐｅＡｒｃｈｉｔｅｃｔｕｒｅꎬＦｕｊｉａｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅａｎｄＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＦｕｚｈｏｕꎬＦｕｊｉａｎ３５...
