ＧｕｉｈａｉａＪｕｌ.２０２３ꎬ４３(７):１３３５－１３４６ｈｔｔｐ://ｗｗｗ.ｇｕｉｈａｉａ－ｊｏｕｒｎａｌ.ｃｏｍＤＯＩ:１０.１１９３１/ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２２０７０５０韩霜ꎬ徐浩ꎬ余静雅ꎬ等ꎬ２０２３.藏茵陈基源植物皱边喉毛花的全长转录组信息分析[Ｊ].广西植物ꎬ４３(７):１３３５－１３４６.ＨＡＮＳꎬＸＵＨꎬＹＵＪＹꎬｅｔａｌ.ꎬ２０２３.Ｆｕｌｌ￣ｌｅｎｇｔｈｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｆｏｒＴｉｂｅｔａｎｍｅｄｉｃｉｎｅ“Ｚａｎｇｙｉｎｃｈｅｎ”ｏｆｏｒｉｇｉｎａｌｐｌａｎｔＣｏｍａｓｔｏｍａｐｏｌｙｃｌａｄｕｍ[Ｊ].Ｇｕｉｈａｉａꎬ４３(７):１３３５－１３４６.藏茵陈基源植物皱边喉毛花的全长转录组信息分析韩霜１ꎬ２ꎬ徐浩１ꎬ２ꎬ余静雅１ꎬ２ꎬ韩赟１ꎬ２ꎬ张发起１∗(１.中国科学院西北高原生物研究所高原生物适应与进化重点实验室ꎬ西宁８１０００１ꎻ２.中国科学院大学生命科学学院ꎬ北京１０００３９)摘要:皱边喉毛花为藏药藏茵陈基源植物之一ꎬ其包含丰富的药用成分ꎮ为进一步了解皱边喉毛花转录组ꎬ丰富其基因注释、代谢通路等遗传信息ꎬ该研究利用ＰａｃＢｉｏ测序平台对皱边喉毛花叶片进行全长转录组测序ꎮ结果表明:(１)全长转录组测序共获得１７Ｇｂ的高质量数据ꎬ对７９５６９８个环形一致性序列(ＣＣＳ)序列进行聚类和去冗余ꎬ最终获得８７８１４条高质量的全长转录本ꎮ(２)与７个数据库比对后ꎬ共有２７７４５１条转录本注释成功ꎬ其中注释到ＮＲ数据库的转录本最多ꎬ有３９２１４条ꎮ２６３９６条转录本成功注释到ＫＯＧ数据库中ꎬ共有２６个子类ꎮ３９１０４条转录本注释到ＫＥＧＧ数据库中ꎬ涉及６个主要通路和４０个子通路ꎮ３９１０２条转录本注释到ＧＯ数据库中ꎬ按分子功能、生物学过程和细胞成分３大类对注释成功的转录本进行分类ꎮ(３)ＳＳＲ分析共鉴定到２２８６１个ＳＳＲꎬ其中单碱基重复最为丰富ꎻ共检测到１８７４个转录因子和１５１６６个长非编码ＲＮＡ(ＬｎｃＲＮＡ)ꎬ而注释到转录本最多的转录因子家族是Ｃ３Ｈꎮ(４)筛选出５５条与单萜类及黄酮类化合物合成相关的转录本ꎮ该研究结果丰富了皱边喉毛花的转录组信息ꎬ为进一步筛选皱边喉毛花药用成分合成相关的关键基因提供了重要的遗传资源ꎮ关键词:皱边喉毛花ꎬ全长转录组ꎬ代谢通路ꎬ转录因子ꎬ长非编码ＲＮＡ中图分类号:Ｑ９４３文献标识码:Ａ文章编号:１０００￣３１４２(２０２...
