ICS65.020.30B41DB12天津市地方标准DB12/T1019—2020猪德尔塔冠状病毒RT-PCR检测方法RT-PCRassayfordetectionofporcinedeltacoronavirus2020-12-28发布2021-02-01实施天津市市场监督管理委员会发布DB12/T1019—2020I前言本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则编写。本标准由天津市农业农村委员会提出并归口。本标准起草单位:天津市畜牧兽医研究所。本标准主要起草人:李秀丽、鄢明华、郑丽、路超、田向学、张莉、李富强、江珊、任卫科、董志民。DB12/T1019—20201猪德尔塔冠状病毒RT-PCR检测方法1范围本标准规定了猪德尔塔冠状病毒(porcinedeltacoronavirus,PDCoV)RT-PCR检测方法的原理、仪器设备与试剂、样品对照、方法步骤和结果判定等技术内容。本标准适用于猪肠内容物、粪便以及细胞培养物中PDCoV核酸的检测。2缩略语下列缩略语适用于本文件。PDCoV:猪德尔塔冠状病毒(porcinedeltacoronavirus)PCR:聚合酶链式反应(polymerasechainreaction)RT-PCR:反转录聚合酶链式反应(reversetranscription-polymerasechainreaction)RNA:核糖核酸(ribonucleicacid)DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)cDNA:互补脱氧核糖核酸(complementaryDNA)PK-15细胞:猪肾细胞(porcinekidneycell)DEPC:焦炭酸二乙酯(diethylpyrocarbonate)Taq酶:TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)dNTP:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleosidetriphosphate)M-MLV:莫洛尼氏鼠白血病病毒(moloneymurineleukemiavirus)PBS:磷酸缓冲液(phosphatebuffersolution)TAE:Tris-乙酸电泳缓冲液(trisacetate-EDTAbuffer)3原理PDCoV是一种RNA病毒。RNA反转录产生的cDNA可作为PCR模板进行扩增。根据PDCoVM基因保守基因序列设计一对引物,在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以引物为延伸起点,通过变性、退火和延伸,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA。依据PCR试验结果,判断样品中是否含有PDCoV。4主要仪器设备生物安全柜、组织研磨机、涡旋振荡器、台式低温高速离心机、PCR仪、电泳仪、凝胶成像系统、分析天平(精度0.01g)、超低温冰箱(-80℃)等。5试剂与引物5.1试剂DB12/T1019—20202Trizol、氯仿、异丙醇、乙醇、M-MLV反转录酶、RNA酶抑制剂、DEPC处理的灭菌去离子水、TaqDNA聚合酶、dNTP、DL2000DNAMarker、核酸染料、磷酸盐缓冲液(PBS,0.01mol/L,pH7.2)、TAE电泳缓冲液、琼脂糖。相关溶液配制方法见附录A。试剂均为分析纯。5.2引物PDCoVM...