JournalofChengduMedicalCollege,2023,Vol.18,No.3成都医学院学报2023年第18卷第3期278网络出版地址:https://kns.cnki.net/kcms2/article/abstract?urlId=51.1705.r.20230509.0844.002&uniplatform=NZKPTdoi:10.3969/j.issn.1674-2257.2023.03.002·论著·BCL11A在神经细胞中稳定低表达对智能障碍风险基因的转录调控机制*唐小涵1,2,陈金蓉1,苏炳银1,李淑蓉1,2△,解学敏1△1.成都医学院发育与再生四川省重点实验室组织胚胎学教研室(成都610500);2.成都医学院病理学与病理生理学教研室(成都610500)【摘要】目的探究稳定敲降BCL11A对神经发育关键因子的表达影响。方法设计并筛选靶向人源BCL11A的shRNAs,通过慢病毒构建能稳定敲降BCL11A的人神经母细胞瘤细胞株(SH-SY5Y细胞)。首先,利用逆转录荧光定量PCR(RT-qPCR)、蛋白质印迹技术实验体外验证BCL11A的敲降效果,RT-qPCR实验探索BCL11A敲降后皮质发育关键转录因子的表达变化,进而利用转录组测序分析BCL11A敲降后差异基因的富集情况,最终通过染色质免疫共沉淀(ChIP)实验验证差异基因启动子的转录活性标志pPolⅡ以及染色质活性修饰H3K9ac的变化。结果BCL11A敲降后神经元特异转录因子GRM7、BCL11B、CTCF、ADCYAP1R1、NeuroD1/2、PAX6、SATB1/2的表达降低;皮质神经元关键转录因子GRIN1、TCF12、MEF2D的表达升高。转录活性标志pPolⅡ以及染色质活性修饰H3K9ac在GRM7启动子的富集度降低,在GRIN1启动子的富集呈现升高趋势。结论转录因子BCL11A表达缺失可影响智能障碍相关转录因子的转录活性与表达变化。【关键词】慢病毒;BCL11A;CRISPR/Cas9;神经系统【中图分类号】Q291【文献标识码】ATranscriptionalRegulationMechanismsofStableBCL11AKnockdowninNeurononRiskGenesofIntellectualDisabilityTangXiaohan1,2,ChenJinrong1,SuBingyin1,LiShurong1,2△,XieXuemin1△.1.DepartmentofHistologyandEmbryology,KeyLaboratoryofDevelopmentandRegenerationofSichuanProvince,ChengduMedicalCollege,Chengdu610500,China;2.DepartmentofPathologyandPathophysiology,ChengduMedicalCollege,Chengdu610500,China【Abstract】ObjectiveToexploretheeffectofstableknockdownofBCL11Aontheexpressionofkeyfactorsinneurodevelopment.MethodsshRNAstargetinghumanBCL11Aweredesignedandscreened.Humanneuroblastomacellline(SH-SY5Ycells)thatcouldstablyknockdownBCL11Awa...