分子植物育种，2023年，第21卷，第14期，第4618-4626页MolecularPlantBreeding,2023,Vol.21,No.14,4618-4626研究报告ResearchReport虎尾轮转录组测序及生物信息学分析郑晓艳1陈育青1黄建军1郭月丽2*1漳州卫生职业学院药学院,漳州,363000;2漳州卫生职业学院医学技术学院,漳州,363000*通信作者,guoyueliardaiguo@163.com摘要虎尾轮(Urariacrinita(L.)Desv.exDC)为闽南民间常用保肝护肝中草药，是一种极有使用、研究、开发价值的天然药用植物资源，但对其分子机制研究严重滞后，在一定程度上限制了该民间资源的利用和开发。本实验通过IlluminaHiseq对虎尾轮的根和茎转录组测序，采用Trinity软件完成虎尾轮高质量数据转录本拼装，而后进行生物信息学分析。研究结果表明：总共获得的高质量unigene有255407896个，N50的长度是992bp，其平均长度是559.07bp；将虎尾轮的122207条unigene与NR、GO、KEGG等7个重要的数据库系统进行比对，获得了虎尾轮基因功能的注释信息，结果表明，有75530条unigene至少注释到1个数据库，占61.8%；虎尾轮的根对茎的差异表达unigene有19714个，其中有9038个上调表达，10676个下调表达。在对虎尾轮根与茎差异基因分析中，利用KEGG数据库代谢途径对132个显著性KO途径分析，发现共挖掘出114个unigene与虎尾轮黄酮类生物合成途径密切相关。提取虎尾轮转录组中与黄酮类生物合成密切相关基因的TPM值，60.71%的基因在根中的TPM值高于茎中的TPM植，根中的表达远高于茎的表达，符合民间习用其根的用法。以上结果为今后进一步挖掘虎尾轮药用活性成分的功能基因、生物合成调控、品质改良等提供参考依据。关键词虎尾轮(Urariacrinita(L.)Desv.exDC);转录组测序;差异表达;黄酮;生物信息学SequencingandBioinformaticsAnalysisofUrariacrinita(L.)Desv.exDCZhengXiaoyan1ChenYuqing1HuangJianjun1GuoYueli2*1CollegeofPharmacy,ZhangzhouHealthVocationalCollege,Zhangzhou,363000;2CollegeofMedicalTechnology,ZhangzhouHealthVocationalCollege,Zhangzhou,363000*Correspondingauthor,guoyueliardaiguo@163.comDOI:10.13271/j.mpb.021.004618AbstractUrariacrinita(L.)Desv.exDCisacommonlyusedChineseherbalmedicineforprotectingtheliverandprotectingtheliverinsouthernFujian.Itisanaturalmedicinalplantresourcewithgreatuse,researchanddevelopmentvalue.However,theresearchonitsmolecularmechanismisseriouslylaggingbehind,whichl...
