国际精神病学杂志JOURNALOFINTERNATIONALPSYCHIATRY2023年第50卷第3期-413-◎◎荟萃分析◎Metaanalysis基于GEO数据库的酒精依赖患者差异表达基因生物信息学分析李幼东、刘政、刘淙淙、彭雨涵、王紫妍邓屹杉、李航、周婉玉、武育颖、刘久楹、常世宁【摘要】目的通过对酒精依赖患者基因数据集进行生物信息学分析，探索酒精依赖发生发展的分子标志物。方法从基因表达数据库（GEO）下载GSE62699表达数据集，包括18例酒精依赖患者及18例健康人群的伏隔核组织样本。使用R软件筛选出差异表达基因，之后对差异表达基因进行功能注释，包括基因本体论（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用STRING数据库构建蛋白互作（PPI）网络并进行分析，使用CytoHubba插件筛选核心基因。最后对所得到的核心基因进行验证。结果在酒精依赖患者和健康人群之间，共分析得到236个差异表达基因，包括131个上调基因105个下调基因。应用CytoHubba插件共得到11个核心基因。通过验证获得4个分子标志物。结论谷氨酸脱羧酶2（GAD2）、基质金属蛋白酶抑制剂1（TIMP1）、胆囊收缩素（CCK）、突触体相关蛋白（SNAP25）、内皮素1（EDN1）可能在酒精依赖的发生发展中发挥作用。【关键词】酒精依赖；GEO数据库；生物信息学【中图分类号】R749【文献标识码】A【文章编号】1673-2952（2023）03-0413-05Bioinformaticsanalysisofdifferentiallyexpressedgenesinalcohol-dependentpatientsbasedonGEOdatabaseLIYoudong，LIUZheng，LIUCongcong，etal.DepartmentofClinicalPsychology，theFirstHospitalofHebeiMedicalUniversity，HebeiKeyLaboratoryofBrainScienceandPsychiatricPsycholigicDisease，Shijiazhuang050000，China【Abstract】ObjectiveToexplorethemolecularmarkersforthedevelopmentofalcoholdependencebybioinfor-maticsanalysisofgenedatasetofpatientswithalcoholdependence.MethodsTheGSE62699expressiondatasetwasdownloadedfromtheGeneExpressionDatabase（GEO），includingnucleusaccumbenstissuesamplesfrom18alcohol-dependentpatientsand18healthysubjects.Rsoftwarewasusedtoscreenoutdifferentiallyexpressedgenes，andthenthedifferentiallyexpressedgeneswerefunctionallyannotated，includingGeneOntology（GO）andKyotoEncyclopediaofGenesandGenomes（KEGG）pathwayenrichmentanalysis.TheSTRINGdatabasewasusedtoconstructandanalyzethep...
