实用医学杂志2023年第39卷第9期TheJournalofPracticalMedicine2023Vol.39No.9doi:10.3969/j.issn.1006⁃5725.2023.09.003基金项目:广州市科技计划项目(编号:202002030174)通信作者:罗喜平E⁃mail:luoxiping333@126.com基于转录组测序技术筛选NSUN2在卵巢癌细胞的基因差异表达何婉珊1,2洪小山2陈冠桥1陈斌1文斌2林育3韦之富4罗喜平1,21广州医科大学(广州511436);2广东省妇幼保健院妇科(广州511400);3南方医科大学(广州510515);4暨南大学附属顺德医院妇科(广东佛山528000)【摘要】目的应用RNA⁃seq技术研究NSUN2对卵巢癌细胞株A2780基因表达的影响,为阐明NSUN2在卵巢癌症发生发展中的作用提供理论依据。方法慢病毒介导的RNA干扰技术抑制A2780细胞中NSUN2的表达。以转染空载体的细胞为对照,使用RNA⁃seq技术对干扰细胞株进行基因谱高通量测序分析,筛选出差异表达的基因。并通过KEGGPathway、GO分析和GSEA富集分析,探索NSUN2调控的差异基因主要参与的相关信号通路和生物学过程。结果与对照组细胞相比,NSUN2敲低的A2780细胞株有1642个差异表达的基因,其中上调基因有1020个,下调基因有622个;通过GO分析、KEGGPathway和GSEA富集分析发现差异表达基因主要富集在hedgehog信号通路、P53等信号通路上,参与了病毒转录、翻译起始和调节等生物过程;通过对P53信号通路的相关基因进一步分析,筛选出与改通路相关的3个关键基因(ZMAT3、EI24和CCND2),RT⁃qPCR验证其表达结果与测序结果相符。结论A2780sh⁃NSUN2组与A2780sh⁃NC组的基因表达谱间存在明显的差异,其差异基因主要富集于P53信号通路。在卵巢癌中NSUN2可能通过调控P53信号通路相关因子的表达,从而调控了卵巢癌的发生发展。【关键词】NSUN2;卵巢癌;转录组测序技术;P53信号通路【中图分类号】R711.75ScreeningofgenedifferentialexpressionofNSUN2inovariancancercellsbasedontranscriptomesequenc⁃ingtechnologyHEWanshan*,HONGXiaoshan,CHENGuanqiao,CHENBin,WENBin,LINYu,WEIZhifu,LUOXiping.*GuangzhouMedicalUniversity,Guangzhou511436,China;*DepartmentofGynecology,theGuang⁃dongWomenandChildrenHospital,Guangzhou511400,ChinaCorrespondingauthor:LUOXipingE⁃mail:luoxiping333@126.com【Abstract】ObjectiveToinvestigatetheeffectofgeneexpressionbyNSUN2inovariancancercelllineA2780byRNA⁃seqtechnology,andtoprovideatheoreticalbas...