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基于E165R基因非洲猪瘟LAMP快速检测方法的建立_林涛.pdfVIP免费

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贵州农业科学GuizhouAgriculturalSciences2023,51(3):82~88http://www.gznykx.org.cnDOI:10.3969/j.issn.1001-3601.2023.03.011收稿日期:2022-12-14基金项目:福建省自然科学基金项目(2020J01181)作者简介:林涛(1998-),男,在读硕士,研究方向:生物技术。E-mail:lt18759272710@163.com*通讯作者:张怀东(1982-),男,副研究员,博士,从事病毒学研究。E-mail:zhanghuaidong@fjnu.edu.cn刘峰(1964-),男,副教授,硕士,从事工业微生物研究。E-mail:liufeng@fjnu.edu.en基于E165R基因非洲猪瘟LAMP快速检测方法的建立林涛1,陈珺煜1,王成龙1,李芹1,2,张怀东1,2*,刘峰1,2*(1.福建师范大学生命科学学院,福建福州350117;2.工业微生物发酵技术国家地方联合工程研究中心,福建福州350117)摘要:【目的】建立特异性好、灵敏度高的非洲猪瘟病毒(Africanswinefevervirus,ASFV)环介导等温扩增(Loop-MediatedIsothermalAmplification,LAMP)快速检测方法,为非洲猪瘟的实时实地快速检测提供参考。【方法】通过对非洲猪瘟病毒多种基因型66个毒株的E165R基因多序列比对,选取相对保守区域设计LAMP引物,并对反应条件及反应体系进行优化。在获得的最优反应条件及体系下考察方法的检测特异性和灵敏性。【结果】选取的LAMP检测靶标235bp(29~264bp)在不同基因型ASFV毒株中保守性较好,序列相似度达94.46%~100%;LAMP反应的最佳温度为64℃、时间为35min、Mg2+浓度为8mmol/L、内外引物比为8︰1、BstDNA聚合酶量为16U。建立的ASFV环介导等温扩增检测方法最低检测限为50copies/μL,较常规PCR检测提高1个数量级,且35min即可完成扩增反应。LAMP检测方法与猪圆环病毒2型(PCV2)、伪狂犬病毒(PRV)、猪繁殖与呼吸道综合症病毒(PRRSV)和猪瘟病毒(CSFV)4种临床症状类似的猪病毒感染性疫病没有交叉反应。【结论】基于该新检测靶点的ASFVLAMP检...

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