轻度认知障碍患者血浆中差异表达microＲNA生物信息学分析刘艳于明徐宇浩(江苏大学附属医院神经内科，江苏镇江212001)〔摘要〕目的应用生物信息学方法分析轻度认知障碍(MCI)患者血浆中差异表达microＲNA。方法从美国国立生物技术信息中心(NCBI)公共数据平台的GEO数据库检索并筛选MCI相关基因芯片数据集，使用GEO2Ｒ在线分析工具筛选差异表达的microＲNA;利用TargetScan7.2在线预测工具预测差异表达microＲNA的靶基因，并通过String数据库构建编码蛋白相互作用(PPI)网络及利用Cytoscape的CytoHubba插件筛选关键基因(Hubegene);利用Cytoscape3.7.2软件构建差异表达microＲNA的microＲNA-靶基因相互作用网络，筛选关键microＲNA;运用Ｒ语言分析包对差异表达microＲNA的靶基因进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果筛选出14个显著下调的microＲNAs，通过在线工具预测14个microＲNA的靶基因并构建PPI和microＲNA-靶基因的相互作用网络，结果显示hsa-miＲ-27b、hsa-miＲ-146a、hsa-miＲ-23a和has-miＲ-93*是核心网络中的关键microＲNA。GO富集分析结果显示，关键microＲNA主要参与轴突生成、化学突触传递的调控、跨突触信号的调节、信号释放及糖蛋白代谢等生物学过程。而KEGG通路富集分析结果显示，它们主要参与调控MAPK信号通路、Ｒas信号通路、Hippo信号通路、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOＲ)信号通路、轴突导向及糖胺聚糖的生物合成等信号通路。结论hsa-miＲ-27b、hsa-miＲ-146a、hsa-miＲ-23a和has-miＲ-93*是MCI患者血浆中关键的microＲNAs，可能成为诊断MCI进展至阿尔茨海默病(AD)的候选生物标志物。〔关键词〕轻度认知障碍;阿尔茨海默病;microＲNA(miＲNA);生物标志物〔中图分类号〕Ｒ749.16〔文献标识码〕A〔文章编号〕1005-9202(2023)03-0572-06;doi:10.3969/j.issn.1005-9202.2023.03.018基金项目:2019年镇江市重点研发计划(SH2019036)通信作者:于明(1972-)，男，博士，主任医师，硕士生导师，主要从事痴呆与帕金森病的基础与临床研究。第一作者:刘艳(1996-)，女，硕士，住院医师，主要从事阿尔茨海默病的基础与临床研究。轻度认知障碍(MCI)是介于正常老化和痴呆之间的临界状态〔1〕。研究表明60岁以上的成年人中MCI患病率为6.7%～25.2%，其患病率的增加与年龄的增长及低教育水平高度相关，以男性更为常见〔2〕。据估计，每年有10%～15%的MCI患者会发展为阿尔茨海默病(AD)〔3〕。若及早发现和识别MCI阶段，并对...
