河南农业科学,2023,52(1):125‐133JournalofHenanAgriculturalSciencesdoi:10.15933/j.cnki.1004‐3268.2023.01.013青花菜花蕾发育LncRNAs内参基因筛选裴徐梨1,冯鹏宇1,唐征2,李亚梅1,焦鹏1,荆赞革1,2(1.昆明学院农学与生命科学学院,云南昆明650214;2.温州科技职业学院农业与生物技术学院,浙江温州325006)摘要:在分析青花菜花蕾发育过程长链非编码RNA(LncRNAs)的表达中,筛选稳定表达的内参基因至关重要。通过前期高通量测序筛选出16个候选内参基因,利用qRT-PCR技术检测其表达水平,并结合geNorm、NormFinder和BestKeeper3个软件对16个LncRNAs在青花菜花蕾不同部位和不同发育时期的表达稳定性进行分析。结果表明,在花蕾不同部位中,geNorm算法认为XLOC_000400、XLOC_008536、XLOC_034059为最适内参基因;NormFinder计算XLOC_021473、XLOC_000400、XLOC_034059为最佳内参基因;BestKeeper显示XLOC_025578表达最稳定。在花蕾不同发育时期中,geNorm算法认为XLOC_000108、XLOC_039609、XLOC_021473为最适内参基因;NormFinder计算XLOC_021473、XLOC_039609、XLOC_000108为最佳内参基因;BestKeeper显示XLOC_034059表达最稳定。综合评估后,在花蕾不同部位和不同发育时期中适宜的内参基因对分别为XLOC_000400/XLOC_008536和XLOC_039609/XLOC_021473。关键词:青花菜;内参基因;长链非编码RNA;花蕾中图分类号:S635.9文献标志码:A文章编号:1004-3268(2023)01-0125-09SelectionofLncRNAsReferenceGenesinDevelopmentofFlowerBudinBroccoliPEIXuli1,FENGPengyu1,TANGZheng2,LIYamei1,JIAOPeng1,JINGZange1,2(1.CollegeofAgricultureandLifeSciences,KunmingUniversity,Kunming650214,China;2.CollegeofAgricultureandBiotechnology,WenzhouVocationalCollegeofScienceandTechnology,Wenzhou325006,China)Abstract:InordertopreliminarilyanalyzetheexpressionofLncRNAsduringtheflowerbuddevelopmentofbroccoli,itisveryimportanttoscreenthestablyexpressedinternalreferencegenes.Inthisstudy,16candidateinternalreferencegeneswerescreenedbyhigh‐throughputsequencing.TheexpressionlevelsweredetectedbyqRT‐PCR.Andtheexpressionstabilityof16LncRNAsindifferentpartsanddifferentdevelopmentalstagesofbroccoliflowerbudwasanalyzedbygeNorm,NormFinderandBestKeepersoftwares.Theresultsshowedt...