·论著·DOI:10.3969/j.issn.1672-9455.2023.04.006基于TCGA和GEPIA数据库分析CENPK基因在前列腺癌中的表达及临床意义*陆璐1,谢光宇2,冯耀宁2,谢正飞2,丁启健2,谢智彬2△1.桂林医学院临床医学院,广西桂林541004;2.广西医科大学第五附属医院泌尿外科,广西南宁530021摘要:目的探讨着丝粒蛋白K基因(CENPK基因)在前列腺癌中的表达及其临床意义。方法通过下载癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达谱数据交互分析(GEPIA)数据库相关数据,获得498例前列腺癌患者的mRNA表达水平及临床信息,其中52例患者有配对的癌组织与癌旁组织。分析前列腺癌组织中CENPK基因mRNA表达水平,分析不同特征前列腺癌患者CENPK基因mRNA表达水平,比较CENPK基因高表达组与CENPK基因低表达组总体生存时间(OS)及无进展生存期(DFS),基因富集分析明确CENPK基因调控的相关信号通路。结果498例前列腺癌患者的癌组织和癌旁组织中CENPK基因mRNA的表达水平分别为3.9247±1.0929和3.4066±1.1545,差异有统计学意义(t=3.235,P=0.001)。52例配对的前列腺癌组织和癌旁组织中CENPK基因mRNA的表达水平分别为8.2071±0.2952和3.4066±1.1545,差异有统计学意义(t=28.309,P<0.001)。受试者工作特征(ROC)曲线分析显示CENPK基因可作为一个灵敏度和特异度较高的前列腺癌诊断指标(灵敏度为60.8%,特异度为63.5%,曲线下面积为0.625,95%CI为0.785~0.852)。有生化复发、PSA>4ng/mL、Gleason评分>7分、有肿瘤残留、T分期为T3~T4期、有淋巴结转移的前列腺癌患者CENPK基因mRNA高表达率明显高于无生化复发、PSA≤4ng/mL、Gleason评分≤7分、无肿瘤残留、T分期为T1~T2b期、无淋巴结转移的前列腺癌患者,差异有统计学意义(P<0.05)。CENPK基因高表达组OS及DFS明显短于CENPK基因低表达组,差异有统计学意义(P=0.045、0.003)。基因富集分析显示,CENPK基因可能通过碱基切除修复、核苷酸切除修复、基因复制、剪接体、错配修复等通路影响前列腺癌的发生、发展。结论CENPK基因在前列腺癌组织中呈高表达,且与临床特征及预后关系密切,可作为前列腺癌较好的诊断标志物。关键词:前列腺癌;着丝粒蛋白K基因;癌症基因组图谱;基因表达谱数据交互分析;生物信息学中图法分类号:R737.25文献标志码:A文章编号:1672-9455(2023)04-0455-05ExpressionandclinicalsignificanceofCENPKgeneinprostatecancerbasedonTCGAandGEPIAdatabases*LULu1,XIEGuangyu2,FENGYaoning2,XIEZhengfei2,DINGQijian2,XIEZhibin2△1.ClinicalSchoolofGuilinMedicalColleg...
