83现代检验医学杂志第38卷第1期2023年1月JModLabMed,Vol.38,No.1,Jan.2023基于TCGA数据库构建三阴性乳腺癌预后相关的ceRNA调控网络及分析肖姗姗1,2，李越1，周艳阳1，何谦1（1.西安交通大学第二附属医院检验科，西安710004；2.空军军医大学唐都医院儿科，西安710038）摘要：目的通过分析癌症基因组图谱（thecancergenomeatlas，TCGA）数据库构建三阴性乳腺癌（triplenegativebreastcancer，TNBC）预后相关的竞争性内源性核糖核酸（competitiveendogenousRNA,ceRNA）调控网络。方法从TCGA数据库中下载TNBClncRNA表达RNAseq数据，对TNBC患者的mRNA，miRNA和lncRNA进行差异表达分析，并进一步行生存分析，得到与乳腺癌有明显差异表达同时也对生存有相关性的mRNA，miRNA和lncRNA。同时构建lncRNA-miRNA-mRNA相关ceRNA调控网，再对生存相关lncRNA所相关的mRNA进一步功能富集和注释，并构建蛋白质互作网络最终用关键基因通过人类蛋白质图谱（thehumanproteinatlas，HPA）数据库进行验证。结果在TCGA中共找到TNBC差异表达mRNA2331个、差异miRNA100个和差异lncRNA1269个。ceRNA调控网中的mRNA在细胞黏附、唾液分泌和血小板活化、用于IgA产生的肠道免疫网络、补体和凝血级联反应等信号通路中明显富集。生存分析中，1个差异mRNA(NMUR1），1个差异表达miRNA(hsa-miR-6832-3p)，2个差异表达的lncRNA（AC104809，LINC01297）的表达量均与TNBC患者的预后相关，差异具有统计学意义（P＜0.05）。最后利用HPA数据库对NMUR1蛋白水平和生存分析验证，NMUR1的高表达患者的总生存期显著高于NMUR1低表达组，差异有统计学意义（P＜0.05）。结论成功构建了促进TNBC发生发展的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络，筛选得到生存相关的差异mRNA，miRNA和lncRNA为TNBC发病机制的研究和诊疗生物标志物的探索提供参考依据。关键词：三阴性乳腺癌；癌症基因组图谱；竞争性内源性RNA调控网络中图分类号：R737.9；R730.43文献标识码：A文章编号:1671-7414（2023）01-083-07doi:10.3969/j.issn.1671-7414.2023.01.016ConstructionandAnalysisofceRNARegulatoryNetworkRelatedtoPrognosisofTripleNegativeBreastCancerBasedonTCGADatabaseXIAOShan-shan1,2，LIYue1，ZHOUYan-yang1，HEQian1（1.DepartmentofClinicalLaboratory,theSecondAffiliatedHospitalofXi’anJiaotongUniversity,Xi’an710004,China；2.DepartmentofPediatrics，TangduHospitalofAirForceMilitaryMedicalUniversity，Xi’...
