SOFTWARE软件2022第43卷第12期2022年Vol.43,No.12基金项目：内蒙古自治区科学技术厅研究课题蒙古高原家畜遗传资源库与信息平台建设及种质资源开发利用（2020ZD0007）；内蒙古自然科学基金全基因组重测序数据的变异检测和转录组差异表达分析的高效并行化算法和软件研究（2019MS03014）作者简介：邬学敏（1993—）,女,硕士,助教,研究方向：大数据智能与知识发现；高静（1970—）,女,博士,教授,研究方向：大数据智能与知识发现。基于MongoDB蒙古高原家畜基因组大数据管理系统的设计与实现邬学敏1高静2(1.包头职业技术学院计算机与信息工程系，内蒙古包头014000；2.内蒙古农业大学计算机与信息工程学院，内蒙古呼和浩特010000）摘要：目前,国内外已有许多动物基因组学数据库,却还未有专门针对蒙古高原家畜基因组信息构建的数据库。此外,传统的基因组数据库平台一般采用关系型数据库存储数据,但在面对海量的基因组数据时出现了读写性能差、可靠性低、不易扩展等问题。为解决上述问题,收集整合了牛、绵羊、山羊、骆驼等蒙古高原家畜的基因组数据,应用非关系型数据库,设计并实现了基于MongoDB存储架构的蒙古高原家畜基因组大数据管理系统。该系统的实现为蒙古高原家畜分子生物学研究提供了一个良好的数据平台,也解决了海量基因组数据的存储与管理问题。关键词：基因组学数据库；蒙古高原家畜；海量数据；非关系型数据库；MongoDB中图分类号：TP311.13;TP311.5文献标识码：ADOI：10.3969/j.issn.1003-6970.2022.12.002本文著录格式：邬学敏,高静.基于MongoDB蒙古高原家畜基因组大数据管理系统的设计与实现[J].软件,2022,43(12):004-008+014DesignandImplementationofMongoliaPlateauGenomeBigDataManagementSystemBasedonMongoDBWUXuemin1,GAOJing2(1.DepartmentofComputerandInformationEngineering,BaotouVocationalandTechnicalCollege,BaotouInnerMongolia014000;2.CollegeofComputerandInformationEngineering,InnerMongoliaAgriculturalUniversity,HohhotInnerMongolia010000)【Abstract】：Atpresent,therearemanyanimalgenomicsdatabasesathomeandabroad,butthereisnodatabasespeciallybuiltforthegenomeinformationoflivestockonthemongolianplateau.Inaddition,thetraditionalgenomedatabaseplatformgenerallyusesrelationaldatabasestostoredata,butinthefaceofmassivegenomedata,problemssuchaspoorread-writeperformance,lowreliability,anddi...
