DNA与蛋白质相互作用的结构特征Section7StructuralCharacteristicsofInteractionbetweenDNAandProtein反式作用因子必须与顺式作用元件相结合，才能发挥其调节基因表达的作用。反式作用因子至少含有三个功能域，即DNA结合功能域，转录活性功能域和其它转录因子结合功能域。反式作用因子的DNA结合功能域具有一些带共性的结构特征，如同源结构域、碱性亮氨酸拉链模体、锌指模体等。1.螺旋-转角-螺旋模体（Helix-Turn-Helix（HTH）Motif）1.1原核生物HTH模体（ProkaryoticHTHMotif）色氨酸阻遏因子和分解产物基因激活蛋白（CAP）均为同二聚体，分子结构中含HTH模体，该模体由两段α-螺旋和一段β-转角构成（但需要另外伸出的第三个α-螺旋才能稳定），第二个α-螺旋负责识别DNA大沟序列，故称为识别螺旋（图103）。图103HTH模体的分子结构Fig103MolecularStructureofHTHMotif1.2真核生物HTH模体（EukaryoticHTHMotif）1.2.1同源异型结构域（Homeodomain）同源异型结构域的氨基酸残基序列与原核细胞类似，由三段α-螺旋，环绕一个疏水核心折叠而成。所不同的是识别螺旋较长，在DNA大沟中的定向有所不同，其典型的结合位点是TATA盒（图104）。图104同源异型结构域的分子结构Fig104MolecularStructureofHomeodomain1.2.2MYBHTH模体（MYBHTHMotif）为HTH模体的变体，其结构类似于同源结构域，但其β-转角由5个残基构成，识别螺旋与DNA有较长的接触面（图105）。图105MYBHTH模体的分子结构Fig105MolecularStructureofMYBHTHMotif1.2.3侧翼HTH模体（WingedHTHMotif）侧翼HTH模体是α/βHTH变体，由110个保守的氨基酸残基构成α/β识别螺旋，另外两个翼状环结构与相邻的DNA骨架和小沟相互作用。典型的例子是肝细胞核因子-3γ（HNF-3γ）（图106）。图106侧翼HTH模体的分子结构Fig106MolecularStructureofWingedHTHMotif1.2.4分解产物基因激活蛋白样结构域（CAP-likeDomain）真核生物多种转录激活因子均具有此DNA结合结构域，但与CAP不同，该结构域是以单体形式与DNA大沟结合，其结合靠水介导。典型的例子如转录因子PU.1的ETS结构域（图107）。图107转录因子PU.1的ETS结构域Fig107ETSDomaininTranscriptionfactorPU.11.2.5POU结构域（POUDomain）该结构域由155~162个氨基酸残基组成，有两个独立的球状结构域：POUS和POUH。POUS位于的POUH的N-端，含多个α-螺旋。两个球状结构域分别位于DNA双螺旋两侧大沟内，识别5′-ATGCAAAT-3′八聚碱基序列。其中，POUS结合5...
