新医改政策对医院有四个方面的影响：一是医院要向公益性进行转变，二是医保管理机构规范医生的诊疗行为，三是政府加大对医院的投入来缓解患者就医的压力，四是公立医院改革可全方位调动医务人员的积极性和工作热情。医改方案在定价方面为“国家制定基本药物零售指导价格，在指导价格内，由省级人民政府根据招标情况确定本地区的统一采购价格”。在采购配送方面为“实行公开招标采购，统一配送”。在基本药物使用方面为明确提出“2009年公布国家基本药物目录”，并首次提出“在零售药房也必须配备和使用基本药物”。基本药物定价采用了市场化机制，由政府制定零售指导价。同时，仍然指定城乡基层医疗机构全部配备、使用基本药物，其他医疗机构首选基本药物，基本药物报销比例高。另外，药品审批将更加严格，商业贿赂会逐步治理，医药流通会得到整治。新医改将給医药行业带来上千亿的市场扩容机会，但并不是所有的医药企业都能受益。中投顾问医药行业分析师许玲妮特别提醒道，医改的根本目的是解决老百姓看病贵的问题，所以药价降低是必然，那些无竞争优势（净值，档案，基金吧）、依赖低成本竞争的中小企业将被淘汰，而核心竞争力凸显的龙头企业将牢牢把握住市场扩容机会而长期受益。在备受关注的公立医院改革方面，新方案中提出“推进医药分开，积极探索多种有效方式逐步改革以药补医机制”。医改不仅将医药分离，还会取消公立医院对药品加成15%的收益，医院收入将大幅减少，而有限的政府投入很有可能无法弥补这部分损失。每年全国医院用药大约有4000亿元，按15%的提成算，那么医院在药品上的利润就有600亿元。现在如果要取消医院在这一部分的利润收益，而国家又不能及时补充这一部分钱给医院，那么医院肯定会通过其他方式来弥补，肯定很大一部分就要让药企让利，那么，那些质量不过硬又无成本优势的中小企业就有被市场淘汰的危险。新医改规定由生产企业直接投标而不是由流通企业投标，将引发医药流通企业的洗牌。中投顾问分析师许玲妮指出，由于生产企业直接面对终端的政策规制，客观上加强了生产企业在与流通企业博弈中的优势，提高了生产企业在药品流通中的地位;而流通企业处于夹缝中生存的状态，在博弈中的地位将会下降。流通中间环节将大幅减少，使得药品流通市场份额将大幅压缩。流通企业惟一的出路就是做大做强，成为生产企业不得不依靠、医疗机构不得不利用的中间环节。在这个阶段，流通企业的洗牌和淘汰将进一步加剧。资金雄厚的大企业必...
